[基于ITS-1序列的部分鳚亚目鱼类的分子系统进化关系研究]RNA聚合酶中识别启动序列的亚基

  摘要通过PCR扩增获得了3种中国黄渤海海域的鳚亚目鱼类的线粒体ITS-1基因,并以条斑马鲛为外群,生成供系统发育分析的序列矩阵,利用MEGA 4.0软件分析序列的碱基组成、差异百分比、转换/颠换值等,应用最大简约法(MP)和邻接法(NJ)构建系统发育树。结果表明:在鳚亚目鱼类的ITS-1片段生成的序列矩阵中发现有碱基的插入缺失现象,共有49 bp变异位点,转换/颠换值为1.0;3种鱼ITS-1长度为375-562 bp,其中方氏云鳚的最长,为532-562 bp,六线鳚的最短,为375 bp;锦鳚科的方氏云鳚和云鳚聚为一支;方氏云鳚和云鳚种间遗传距离只有0.02,亲缘关系最近。
  关键词鳚亚目;线粒体DNA;ITS-1基因序列;系统发育
  中图分类号Q959.483文献标识码A文章编号 1007-5739(2012)08-0318-03
  

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