4月14日，新华社电讯，为期两天的中国和菲律宾关于在南海建立信任措施专家工作小组第三次会议在马尼拉结束。会后发表的联合声明说，双方认为中菲发展友好合作符合两国人民的根本利益，同意将继续致力于不让有关分歧影响两国关系发展的大局。
这一条电讯在美国飞机带来的风波中显得太不重要了。事实上，人们也的确有理由怀疑，旷日持久的中菲南海纠纷能就此有什么突破性的进展。
今年3月15日，菲律宾外长金戈纳召见中国驻菲律宾大使，称在黄岩岛海域发现中国渔船，对皮“表示关注”，他说黄岩岛是菲律宾领土的一部分，菲律宾已对该海域行使主权和管辖权。3日19日，外交部发言人朱邦造说，菲律宾无权对黄岩岛附近海域的中国渔船厂登临检查采取措施。中国对黄岩岛拥有主权并实施管辖权的事实已经得到了国际社会的普通遍尊重。
以下是近几年来中菲在黄岩岛附近发生的一些矛盾：
1997年4月25日，莫军方黍在南沙群岛发现三艘中国武装舰艇，莫外交部向中国提出抗议。
1997年4月30日，两艘中国渔船停泊南沙美济礁附近海面游。
1998年11月5日，菲军方抗菌素议中国军舰在黄岩岛附近活动。
1999年1月16日，菲军方指中国正在有争议的美济礁上修建一个新的钢盘混泥土结构，并发现两艘导弹护卫舰在附近海面警戒。
1999年3月2日，中国外交部抗议莫律宾将在面沙中业岛扩建机场跑道并增建军事设施。
1999年6月11日，中国外交部重申黄岩岛是中国固有领土。
1999年6月12日，坚持拥有主权的菲律宾表示相信外交能化解黄岩岛纠纷。
2000年5月26日，在南海作业的中国海南省琼海01068号渔船，因发动机出现故障，漂至菲律宾巴拉望岛附近海域，遭到菲海警围追和枪击，船长行功武当即中弹身亡，7名船员被扣。